Файлова система FAT характеризується таблицею виділення файлів (FAT), яка насправді є таблицею, яка знаходиться у "верхній" частині тома. Для захисту тому у разі пошкодження однієї з них зберігаються дві копії FAT.
Перша структура тому FAT називається BPB (англ. BIOS parameter block) і розташована в області, що зарезервується, в нульовому секторі. Ця структура містить інформацію, що ідентифікує тип файлової системи та фізичні характеристики носія (дискети або розділу на жорсткому диску).
Рядок FAT–таблиці, Що містить запис кластера, в якому знаходиться початок файлу, зберігає номер наступного кластера, який містить продовження файлу і т. д., за допомогою такого ланцюжка посилань фіксується розташування всього файлу на диску.